Il serait le fils de Jean Chappuis, marié le 3 août 1430 avec Jeanne de Chaumont, ce qui pose un problème de date.
Ce Jean Chappuis serait lui-même, selon certaines généalogies contestées, fils de Pierre Chappuis et Alix de Cunières, d'une lignée de seigneurs de Condrieu remontant au XIIe siècle.
Selon Jougla de Morenas, le même Jean Chappuis serait probablement le fils d'un Durand Chappuis vivant en 1377.
Le plus probable est qu'il s'agit d'une famille d'origine bourgeoise, distincte des Chappuis de Condrieu, famille vraisembablement éteinte au XVe siècle.