Fin 1793 - début 1794 : Il est chargé de faire exécuter le décret de la Convention pour l'anéantissement de la ville de Lyon qui se révolte. Par souci d'efficacité, il procède à des exécutions groupées, par la mitraille des canons, faisant 1683 victimes.
Titre de comte accordé à Joseph Fouché. Bayonne (24 avril 1808). BB/29/974, p. 6.
Titre de duc d'Otrante accordé à Joseph Fouché, à la suite du décret du 15 août 1809. Schoenbrunn (15 août 1809). BB/29/1035, p. 39.